Naczelnik Wielkopolskiego Urzędu Celno-Skarbowego w Poznaniu jest organem Krajowej Administracji Skarbowej oraz organem niezespolonej administracji rządowej podlegającym Dyrektorowi Izby Administracji Skarbowej w Poznaniu i Ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych.
Naczelnik wykonuje swoje zadania przy pomocy Urzędu Celno-Skarbowego.
Urząd Celno-Skarbowy działa na podstawie:
- ustawy z dnia 16 listopada 2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej;
- ustawy z dnia 16 listopada 2016 r. Przepisy wprowadzające ustawę o Krajowej Administracji Skarbowej;
- rozporządzenia Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 24 lutego 2017 r. w sprawie terytorialnego zasięgu działania oraz siedzib dyrektorów izb administracji skarbowej, naczelników urzędów skarbowych i naczelników urzędów celno- skarbowych oraz siedziby dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej;
- zarządzenia Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 1 marca 2017 r. w sprawie utworzenia delegatur jednostek organizacyjnych Krajowej Administracji Skarbowej oraz terytorialnego zasięgu ich działania i siedzib;
- zarządzenia Ministra Finansów z dnia 5 lutego 2019 r. w sprawie organizacji Krajowej Informacji Skarbowej, izby administracji skarbowej, urzędu skarbowego, urzędu celno-skarbowego i Krajowej Szkoły Skarbowości oraz nadania im statutów;
- przepisów odrębnych;
- regulaminu organizacyjnego.
W sprawach organizacyjno-finansowych obejmujących obsługę finansową i kadrową, zarządzanie majątkiem, remonty i inwestycje, zamówienia publiczne, obsługę prawną, audyt wewnętrzny, kontrolę zarządczą, komunikację, zarządzanie bezpieczeństwem informacji, zarządzanie kryzysowe, sprawy obronne, ochronę informacji niejawnych, ochronę osób i mienia, bezpieczeństwo i higienę pracy oraz ochronę przeciwpożarową Izba Administracji Skarbowej, wraz z podległymi urzędami skarbowymi i urzędem celno-skarbowym, tworzy jednostkę organizacyjną.